三分排列3

tRF&tiRNA測序

  • 簡介
  • 服務特點
  • 結果展示
  •       tRFs和tiRNAs是tRNA及其前體通過精確調控的加工過程產生的,作為小非編碼RNA行使多種生理功能,與諸多生理病理過程相關(圖1)。據報道,tRFs&tiRNAs能夠以microRNA的方式參與RNA干擾;結合蛋白因子并調節目標mRNA的穩定性;與細胞色素C互作,調控細胞凋亡;改變胚胎轉錄級聯調控,作為父本表觀遺傳因子介導代謝疾病遺傳;多種應激條件下促進應激顆粒的組裝。

          tRF&tiRNAs的組成和數量高度依賴于具體的細胞類型和病理狀況,使得它們成為一類極佳的生物標志物[1]。例如,tRFs&tiRN-As之間的比例關系能夠作為癌癥存活期指標和潛在的診斷標志物[2]。同時,相比其他microRNA,tRNA和tRFs&tiRNAs類群廣泛富集于各種生物體液中[3-4]


     

    圖1. tRFs&tiRNAs功能及相關疾病

    Aksomics(康成生物)tRF&tiRNA測序服務提供從樣品到數據的全套解決方案。根據我們tRF&tiRNA測序和表達譜分析中得到的豐富信息,按照tRF&tiRNA:為什么以及如何研究它們?中提供的方法及應用,科研工作者們能夠更便捷地推進他們在這個新興領域的研究工作。


    參考文獻 

    1. Telonis A.G. et al. (2015) "Dissecting tRNA-derived fragment complexities using  personalized transcriptomes reveals novel fragment classes and unexpected dependencies." Oncotarget 6(28):24797-822 [PMID: 26325506]

    2. Olvedy M. et al. (2016) "A comprehensive repertoire of tRNA-derived fragments in prostate cancer." Oncotarget [PMID: 27015120]

    3. Schageman J. et al. (2013) "The complete exosome workflow solution: from isolation to characterization of RNA cargo." Biomed Res Int 2013:253957[PMID:24205503]

    4. Dhahbi J.M. et al. (2013) "5' tRNA halves are present as abundant complexes in serum, concentrated in blood cells, and modulated by aging and calorie restriction." BMC Genomics 14:298 [PMID: 23638709]



  • 1. 性能優化的測序方法與嚴格的質控過程
    2. 使用Arraystar獨家授權的"tRF & tiRNA Analysis System"
        ?基于tRNA拓撲結構和統計顯著性的精準注釋與分類系統
        ?全面的tRFs&tiRNAs數據庫信息
        ?tRFs&tiRNAs專注的生物信息學與統計學分析
    3. 額外的miRNA表達和差異分析 
    4. 出版級的數據和圖表展示 
    5. 無縫鏈接tRNA系列服務:tRNA-seq、tRF&tiRNA PCR array和tRNA PCR array

  •        為了更好地了解tRFs及tiRNAs的生物學特征,促進它們在生物標志物方面的應用,tRF&tiRNA-seq提供了豐富的生物信息學分析。額外福利:其他microRNA的表達分析也包含其中!
    1.表達及差異表達譜


     

    圖2. 表達及差異分析數據表


    2.詳盡的注釋信息


     

     

    圖3. 詳盡注釋的tRF&tiRNA序列、家族、二級結構以及剪切位點


    3. tRF&tiRNA在4種小RNA類型中的分布

     

    圖4. tRF&tiRNA與其他相似尺寸小RNA之間的相對含量關系,在多種組織中,tRF&tiRNA的占較高甚至主要比例,這強烈預示了其重要的生理功能和生物標志物應用潛質。