三分排列3

RNA測序

  • 簡介
  • 服務特點
  • 結果展示
  •       相對于傳統的芯片雜交平臺,RNA測序無需預先針對已知序列設計探針,即可在轉錄本水平和基因水平對整體轉錄活動進行檢測。并且具有定量更準確,檢測通量更高,檢測范圍更廣等優點。此外,在分析轉錄本的結構和表達水平的同時,還能發現未知轉錄本和稀有轉錄本,精確地識別可變剪切位點以及可能的點突變,提供最全面的轉錄組信息。

    Aksomics(康成生物)基于Illumina高通量測序平臺,為您提供一站式RNA測序技術服務,您只需要提供保存完好的組織或細胞標本,Aksomics的技術服務人員就可為您完成全部實驗操作,包括RNA抽提、rRNA去除、文庫構建、高通量測序和數據分析、并提供完整的實驗報告。



  • 1.采用rRNA去除方法富集,檢測更為全面

           采用去rRNA的方法進行RNA富集,同時保留帶PolyA尾和不帶PolyA尾的RNA,為您的研究提供全面可靠的數據。


    *圖釋Aksomics的RNA富集方案能夠有效的保留帶PolyA尾巴和不帶PolyA尾巴的轉錄本,從而為客戶提供更加全面可靠的數據。  


    2.可采用降解的RNA進行實驗,特別適用于臨床樣品(如FFPE樣品)的檢測

           Aksomics采用的去rRNA試劑盒能夠有效的去除降解的rRNA,對功能性的RNA分子進行有效的富集, 特別適用于臨床樣品的檢測。


     

    *圖釋:Aksomics的RNA富集方案適用于降解的RNA樣品。 


    3.鏈特異性文庫構建

           采用的鏈特異性文庫構建方法,可以有效區分正義鏈和反義鏈,幫助您同時獲得準確的正義鏈和反義鏈RNA的表達信息。

     

    *圖釋:Aksomics采用鏈特異性的建庫方法,可以有效區分正義轉錄本和反義轉錄本。


    4.均勻覆蓋轉錄本,5’和3’端偏好性低

           采用基于dUTP的建庫方案,Reads均勻覆蓋轉錄本,測序結果更可靠。


     

    圖釋:啟動子區的RNA-SeqChIP-Seq可視化信號


  • 1.基因集富集分析(GSEA):利用一列(排序的)基因進行基因集富集分析,能夠揭示這些基因在不同基因集間的富集情況。


     

    圖釋:基因集富集分析顯示在Cell Cycle Pathway基因集中富集


    2.網絡分析:通過GO富集分析挑選感興趣的GO term,對其中的基因構建基因網絡圖。


    圖釋:GO term-基因網絡圖,綠色和藍色:特異基因;紅色:共有基因


    3. RNA-Seq和ChIP-Seq整合分析:通過整合RNA-Seq結果和ChIP-Seq富集峰,能夠更直觀地了解基因啟動子區的特征。


    圖釋:啟動子區的RNA-Seq和ChIP-Seq可視化信號