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靶向代謝組學

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  •        代謝組學技術 (Metabolomics) 是后基因時代發展起來的系統生物學新技術,旨在測定生物體內所有小分子代謝產物。靶向代謝組學( Targeted Metabolomics)是代謝組學研究的重要組成部分,主要是以標準品為參照,對特定的代謝物群進行有針對性地、特異性地檢測與分析。從定量角度來說,非靶向代謝組學主要檢測樣品中代謝物的相對含量,而靶向代謝組學更重要的是對代謝物在樣品中的絕對含量進行測定。相對于全代謝組分析而言,靶向代謝組分析具有特異性強、檢測靈敏度高和定量準確等特點。

           通過對血液、尿液或組織中特定代謝物的富集與準確定量定性分析,一方面可以結合蛋白質組學、轉錄組學和代謝組學數據揭示相關的分子生物學作用機制,獲得更完整的生命圖譜;另一方面,也可以為后續代謝分子標志物的深入研究和開發利用提供有力支持,并最終用于疾病機理研究、藥物靶點發現及疾病診斷和治療。

    圖1.靶向代謝組學技術原理


           Aksomics(原康成生物)提供完全的靶向代謝組學檢測分析服務。您只需要提供所需的生物樣本,我們將為您完成從樣品制備到數據分析的全部工作流程,并且提供玩完整的分析報告。


    參考文獻

    1. Zhou, J., et al., Development and Evaluation of a Parallel Reaction Monitoring Strategy for Large-Scale Targeted Metabolomics Quantification. Analytical Chemistry, 2016. 88(8): p. 4478-4486.



  • 圖2. 靶向代謝組學實驗流程



  •        近幾年來,隨著分辨率和掃面速度的提升,高分辨質譜儀已經應用到不同疾病的代謝組學中,多種定性定量平臺隨之出現。Juntuo Zhou等人[1]使用Orbitrap LC-MS系統,借助PRM(parallel  reaction monitoring)的技術,開發了一種基于PRM模式的大規模代謝組學定量方法。


           JuntuoZhou等人借助普通生物樣品和臨床樣本評估了PRM測定的動態范圍、線性、重現性以及適用性。同時,還對基于Q-Exactive的PRM和MS1的定量策略以及基于QTRAP6500中的MRM定量策略進行了比較。結合Skyline軟件,通過PRM鑒定到237種極性代謝物。相比于MS1定量具有更好的重現性和定量準確性,并且比基于QTRAP 6500的MRM定量具有更大的靈活性。建立了一種可靠的PRM方法,可用于大規模靶向代謝組學,為基礎和臨床代謝組學研究提供了新的選擇。

    對比基于Q-Exactive的PRM和MS1的定量策略和基于QTRAP 6500中的MRM定量策略。



    通過2型糖尿病代謝表型(上)驗證評估PRM定量方法。





  • ? 驗證非靶向代謝組學的實驗結論

    ? 分子機制研究

    ? 疾病標志物的篩選



  • Agilent HPLC 1260     

    Agilent QQQ 6460




  • 樣品類型

    樣品要求

    血漿、尿液等體液樣品

    血清、血漿、腦脊液>1mL,尿液>20mL

    細胞樣品

    細胞量>2x107

    組織樣品

    動物、微生物組織濕重 >100mg