三分排列3

轉錄組學

  • lncRNA芯片結果包含基本數據分析有哪些?深入數據分析有哪些?

    基本數據分析:差異表達mRNA及LncRNA;分層聚類,Scatter Plot(散點圖),volcano plot;差異表達mRNA的GO和pathway分析;特色lncRNA子類分析。


    深入數據分析:CNC分析;ceRNA分析;趨勢(STEM)分析;lncRNA-GSEA分析;差異高保守lncRNA、差異組織特異性lncRNA、差異生物學過程相關lncRNA、差異疾病相關lncRNA分析(僅針對human lncRNA芯片 V4.0)。

  • 為什么LncRNA芯片報告中有重復行?

           LncRNA有重復行是因為報告中會注釋lncRNA的臨近基因轉錄本,而當一個lncRNA有多個臨近基因轉錄本,在報告中的具體表現就是出現多行,而每一行的區別就是注釋的Associated_gene_acc名稱不同。

  • 我想在購買芯片服務之前看看感興趣的lncRNA是否在芯片上。貴公司是否可以提供芯片上所有lncRNA探針的詳細序列列表?

    Arraystar不提供芯片上所有探針的列表,這些數據屬于Arraystar知識產權。但是,您可以將lncRNA列表發送給我們,我們可以和arraystar的技術支持聯系查詢,以確定芯片上是否包含您感興趣的LncRNA。
  • 是否每個lncRNA都有polyA 尾巴?數據庫里是否是全長序列,是否一定要做RACE?

           約75%的lncRNA具有polyA尾巴,其余的沒有。“source”為RefSeq、UCSC或GENCODE數據庫的lncRNA是經過充分驗證確定的lncRNA,不用做RACE,更建議選用。“source”為其他數據庫的lncRNA需要RACE獲取詳細的序列信息。


  • Arraystar lncRNA芯片探針設計如何做到轉錄本特異性?有什么優勢?

    同一個基因轉錄的不同轉錄本都設計有單獨的檢測探針,這些探針設計在不同轉錄本特異的區域,如外顯子剪接拼接位點。能夠實現對不同轉錄本的準確、特異性檢測,這對分析lncRNA功能極為關鍵。

FAQ其它分類